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5月28日，四川農(nóng)業(yè)大學(xué)、中科院遺傳與發(fā)育研究所、河北大學(xué)等單位合作在Cell雜志發(fā)表了題為：“Pan-genome analysis based on 33 high-quality assemblies provides insights into hidden genomic variations in rice”的研究論文。河北大學(xué)杜會龍教授為論文共同第一作者。

在作物進(jìn)化和馴化過程中，基因組結(jié)構(gòu)變異（SVs）和基因拷貝數(shù)變異（gCNVs）是重要的遺傳變異來源，到目前為止，還未有對SV和gCNV全面準(zhǔn)確的鑒定報道。

研究人員選取了遺傳背景具有高度代表性的33個水稻材料，并對其中31份材料進(jìn)行了長片段PacBio測序、高質(zhì)量基因組組裝及基因注釋。同時，研究人員對33個高質(zhì)量的水稻基因組進(jìn)行了系統(tǒng)的基因組比較分析，鑒定到了大量先前尚未發(fā)現(xiàn)的SVs和gCNVs，探究了SV在亞洲栽培稻群體中的分布規(guī)律和形成機(jī)制，揭示了大量SVs和 gCNVs與基因表達(dá)量變化顯著相關(guān)，發(fā)現(xiàn)了多個與重要農(nóng)藝性狀相關(guān)的復(fù)雜優(yōu)異等位變異，證實(shí)了SV和gCNV對調(diào)控水稻農(nóng)藝性狀的重要作用。

黃色標(biāo)記部分為河北大學(xué)杜會龍課題組參與人員

杜會龍教授

杜會龍，教授，畢業(yè)于中科院遺傳與發(fā)育研究所，河北大學(xué)高層次引進(jìn)人才，以第一作者（含共同）在Cell（2020，2021，2021）、Nature Communications（2017，2019）、Molecular Plant（2017，2020）和Science China Life Sciences（2019，2020）發(fā)表多篇論文。目前課題組主要開展的研究方向是基于各類測序數(shù)據(jù)的基因組組裝軟件開發(fā)，復(fù)雜植物的高質(zhì)量基因組構(gòu)建及后續(xù)比較基因組、三維基因組調(diào)控、功能基因組分析、群體分析、基于圖形基因組的泛基因組分析以及生物信息學(xué)個性化分析流程搭建等研究工作。